掌上離心機體型雖小，使用時該注意的事項一樣也不能少。尤其在機器運行過程中不要去打開蓋子（現在大部分掌上離心機都設置了開蓋即停的保護措施），以免高速運轉的設備飛出，造成危險。關于儀器的使用注意事項，如下：
1.使用時需將掌上離心機放置于水平位置，外接電源的電壓要與儀器匹配，并要求有良好的接地線。儀器周圍不要堆放雜物，至少留10cm以上的空間方便儀器散熱。
2.開機前先檢查掌上離心機的轉頭安裝是否牢固，機腔有無異物掉入。檢查地腳螺栓、轉鼓、三角帶以及制動裝置等是否完好無損，能否正常工作。
3.樣品應預先平衡，使用離心筒時，離心筒與樣品應同時平衡。不僅要保證樣品等重平衡，還要考慮密度和體積的平衡。因為離心時產生的力矩不僅與樣品的種類相關，還與樣品的選擇半徑相關。若在負載不平衡狀態下啟動離心機，可能會損壞設備，甚至傷及操作者。
4.對揮發性或腐蝕性液體離心時，應使用帶蓋的離心管，避免液體泄露損壞儀器或發生危險。
5.避免使用非標準試管插入離心機轉子。
6.離心機的頂蓋打開時，請勿運行設備。離心完成后，等儀器完全停止轉動再打開頂蓋。若離心機運轉過程中出現異常，應立即關閉電源，報請技術人員維修。
7.掌上離心機一次使用的時間一般為1~2分鐘，實驗人員應全程照看，不得離開，以免發生意外。
8.掌上離心機用完要及時清潔，擦拭機腔時動作要輕，防止損壞溫度感應器。
9.離心機平時應放置于干燥的室溫條件下，避免陽光直射，避免劇烈的溫度變化，防水防潮。
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